Příliš mnoho bílkovin může totiž ovlivnit to, jak tělo funguje, zejména pak to, jak se zbavuje odpadních látek. Zásadní roli v očišťování těla od odpadních látek přitom hrají ledviny: odvádějí z organismu zplodiny metabolismu, kyseliny a přebytečnou vodu.
Nemocné ledviny na rozdíl od zdravých nejsou schopny dokonale odfiltrovat odpadní látky, které se tvoří při odbourávání bílkovin v těle. Ty se pak hromadí v krvi a mohou způsobovat vážné zdravotní potíže.
Problém to je například u obézních pacientů s cukrovkou. Strava s vysokým obsahem bílkovin může podpořit již existující chronické onemocnění ledvin mírného stupně, které se často vyskytuje právě u lidí s diabetem.
Při výběru diety je tedy vždy třeba přihlédnout k celkovému stavu našeho zdraví. Vysokoproteinovou dietu nelze například doporučit lidem, kteří trpí chronickou ledvinovou nedostatečností nebo kteří mají v anamnéze ledvinové kameny či některé vzácné genetické stavy, jako je například fenylketonurie.